Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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