Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lrfn4Q80XU8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Lrfn4Q80XU8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Lrfn4Q80XU8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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