Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms