Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2bQ7TPM1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms