Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms