Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Topbp1Q6ZQF0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms