Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg9aQ68FE2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg9aQ68FE2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms