Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Taf6Q62311 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Taf6Q62311 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Taf6Q62311 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Taf6Q62311 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Taf6Q62311 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Taf6Q62311 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Taf6Q62311 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Taf6Q62311 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Taf6Q62311 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Taf6Q62311 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Taf6Q62311 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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