Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Sall3Q62255 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sall3Q62255 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms