Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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