Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Atf3Q60765 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf3Q60765 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms