Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psme4Q5SSW2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Psme4Q5SSW2 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Psme4Q5SSW2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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