Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Trim58Q5NCC9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim58Q5NCC9 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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