Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms