Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms