Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms