Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem253Q3UNB8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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