Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rnf40Q3U319 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rnf40Q3U319 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rnf40Q3U319 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rnf40Q3U319 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf40Q3U319 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rnf40Q3U319 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Rnf40Q3U319 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Rnf40Q3U319 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf40Q3U319 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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