Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rnf149Q3U2C5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms