Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms