Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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