Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms