Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gdf3Q07104 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms