Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl23aP62751 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl23aP62751 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms