Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
FmodP50608 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
FmodP50608 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms