Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms