Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprkP35822 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprkP35822 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms