Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb9P28076 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms