Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RarbP22605 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RarbP22605 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RarbP22605 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms