Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prim1P20664 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prim1P20664 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms