Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pou4f1P17208 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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