Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms