Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P04213 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04213 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04213 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04213 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04213 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04213 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04213 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04213 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04213 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04213 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04213 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04213 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04213 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04213 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04213 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04213 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P04213 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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