Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Copb2O55029 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Copb2O55029 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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