Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gcm2O09102 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gcm2O09102 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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