Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sec22bO08547 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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