Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm2056J3QQ02 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms