Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm3727J3QM54 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm3727J3QM54 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm3727J3QM54 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3727J3QM54 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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