Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm21060J3KMU4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms