Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srp72F8VQC1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srp72F8VQC1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Srp72F8VQC1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Srp72F8VQC1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srp72F8VQC1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Srp72F8VQC1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srp72F8VQC1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Srp72F8VQC1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Srp72F8VQC1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Srp72F8VQC1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srp72F8VQC1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Srp72F8VQC1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srp72F8VQC1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Srp72F8VQC1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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