Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syde2E9PUP1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms