Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Phf11bB4XVQ1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Phf11bB4XVQ1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Phf11bB4XVQ1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Phf11bB4XVQ1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Phf11bB4XVQ1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms