Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf39A2RT81 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms