Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn3aA2ASI5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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