Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Prdm16A2A935 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Prdm16A2A935 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Prdm16A2A935 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Prdm16A2A935 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Prdm16A2A935 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Prdm16A2A935 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Prdm16A2A935 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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Prdm16A2A935 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Prdm16A2A935 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm16A2A935 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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