Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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RfxankQ9Z205 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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RfxankQ9Z205 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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RfxankQ9Z205 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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RfxankQ9Z205 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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RfxankQ9Z205 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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RfxankQ9Z205 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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RfxankQ9Z205 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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RfxankQ9Z205 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
RfxankQ9Z205 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RfxankQ9Z205 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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