Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Plod2Q9R0B9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms