Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms