Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cabp2Q9JLK4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cabp2Q9JLK4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cabp2Q9JLK4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cabp2Q9JLK4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cabp2Q9JLK4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cabp2Q9JLK4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cabp2Q9JLK4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cabp2Q9JLK4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cabp2Q9JLK4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cabp2Q9JLK4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms