Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Smg9Q9DB90 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Smg9Q9DB90 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Smg9Q9DB90 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Smg9Q9DB90 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Smg9Q9DB90 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Smg9Q9DB90 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Smg9Q9DB90 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Smg9Q9DB90 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smg9Q9DB90 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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